49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3205 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  56.5 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  55.16 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  48.37 
 
 		 265 aa  161  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  48.09 
 
 		 243 aa  148  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  53.78 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  44.4 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  43.89 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  46.58 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  46.51 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  46.51 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  46.05 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  44.8 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  36.61 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  27.75 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  27.31 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  30.13 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  43.51 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  45.51 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  36.82 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  35.35 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  36.25 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  29.1 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  32.48 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  36.16 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  28.64 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  27.6 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  32.43 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  25.99 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.75 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  27.63 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  31.82 
 
 		 666 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  33.94 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  27.63 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  30.53 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  28.83 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  23.35 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  33.79 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  29.41 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  36.69 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  32.54 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  32.09 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.08 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  23.72 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  32.34 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06573  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182291  normal  0.0690952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>