More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3170 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  64.41 
 
 		 580 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  100 
 
 		 575 aa  1095    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  64.07 
 
 		 573 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  60.49 
 
 		 546 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  60.04 
 
 		 546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  56.1 
 
 		 580 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  55.54 
 
 		 580 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  55.76 
 
 		 578 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  55.8 
 
 		 580 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  52.93 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  53.18 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.22 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  47.86 
 
 		 591 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  49.19 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  77.82 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  47.04 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  74.56 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  60.54 
 
 		 505 aa  287  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  60.92 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  59.07 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  56.2 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  39.19 
 
 		 693 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  31.37 
 
 		 590 aa  184  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.49 
 
 		 659 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  29.74 
 
 		 584 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.54 
 
 		 584 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.74 
 
 		 584 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 665 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  29.42 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.32 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  29.83 
 
 		 683 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.5 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  30.72 
 
 		 657 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  30.33 
 
 		 659 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  28.1 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  30.23 
 
 		 683 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  27.81 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  27.61 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  27.6 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  27.4 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  29.76 
 
 		 671 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  29.79 
 
 		 671 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  29.32 
 
 		 671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  28.51 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  29.98 
 
 		 671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  29.32 
 
 		 671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.39 
 
 		 672 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  30.19 
 
 		 671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.86 
 
 		 671 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  27.45 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  27.45 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 		 687 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  27.4 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.63 
 
 		 671 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  29.62 
 
 		 672 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  30.63 
 
 		 807 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  27.81 
 
 		 688 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  30.63 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.63 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  30.63 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  27.2 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  30.63 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  28 
 
 		 681 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  29.71 
 
 		 671 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  29.82 
 
 		 672 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  27.58 
 
 		 572 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  30.19 
 
 		 671 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27 
 
 		 577 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  29.48 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  27.83 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  29.28 
 
 		 661 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  29.29 
 
 		 703 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  28.3 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  29.41 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  26.51 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  30.12 
 
 		 552 aa  127  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 722 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 722 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  25.21 
 
 		 567 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  27.34 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  30.06 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 705 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  25.39 
 
 		 552 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  30.17 
 
 		 759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  29.57 
 
 		 572 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  29.44 
 
 		 699 aa  120  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  27.16 
 
 		 713 aa  120  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 572 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 572 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 702 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  25.92 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  28.66 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  25.71 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  28.75 
 
 		 578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  28.75 
 
 		 578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>