More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3132 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  65.64 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  64.62 
 
 
223 aa  247  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  61.54 
 
 
198 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  57.95 
 
 
200 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  56.92 
 
 
203 aa  204  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  58.03 
 
 
193 aa  201  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  51.56 
 
 
191 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  65.71 
 
 
178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  52.85 
 
 
194 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  51.01 
 
 
200 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 
238 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 
190 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  46.07 
 
 
196 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  48.96 
 
 
198 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  47.67 
 
 
193 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 
194 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 
200 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  48.9 
 
 
206 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  48.44 
 
 
240 aa  154  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 
193 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 
194 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
202 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.81 
 
 
210 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  47.42 
 
 
195 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  44.26 
 
 
203 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  48.7 
 
 
193 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  45.5 
 
 
203 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  44.97 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  44.97 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  43.17 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  43.17 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  39.71 
 
 
234 aa  138  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 
212 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  40.27 
 
 
236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  41.26 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  45.32 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 
206 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  36.94 
 
 
237 aa  117  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  40.1 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
244 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
447 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.77 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.27 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.87 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.87 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.1 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
445 aa  77.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7018  hypothetical protein  77.08 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
448 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.47 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.73 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.9 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.84 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>