More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3111 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  48.77 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 383 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.05 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  33.68 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  33.5 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  36.75 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  35.42 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
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NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
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NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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