More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3110 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
697 aa  1389    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  44.05 
 
 
573 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.23 
 
 
616 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  41.22 
 
 
817 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.74 
 
 
1045 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.99 
 
 
579 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
855 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  40.04 
 
 
591 aa  355  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  41.73 
 
 
1039 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
754 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.06 
 
 
713 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37 
 
 
1432 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 
722 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 
765 aa  228  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.93 
 
 
952 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
1225 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.43 
 
 
753 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
744 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 
776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 
688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.36 
 
 
743 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.5 
 
 
738 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  37.03 
 
 
713 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.64 
 
 
549 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 
745 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  30.58 
 
 
716 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.39 
 
 
583 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 
594 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 
643 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 
721 aa  165  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 
528 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
1711 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.22 
 
 
750 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  33.19 
 
 
805 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.58 
 
 
688 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.55 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  32.25 
 
 
562 aa  154  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
1385 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.86 
 
 
692 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  36.03 
 
 
453 aa  150  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
1361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40 
 
 
697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  35.95 
 
 
685 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  41.12 
 
 
693 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.86 
 
 
553 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  27.3 
 
 
574 aa  144  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  28.65 
 
 
570 aa  144  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  30.48 
 
 
760 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  29.95 
 
 
771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
746 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  32.24 
 
 
757 aa  141  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  32.91 
 
 
537 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 
932 aa  141  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 
583 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.32 
 
 
828 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  32.18 
 
 
693 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  37.65 
 
 
672 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 
547 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.68 
 
 
538 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 
866 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.11 
 
 
1051 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 
607 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.07 
 
 
709 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 
1017 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.74 
 
 
692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 
865 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
1370 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.68 
 
 
851 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.33 
 
 
711 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.99 
 
 
748 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  39.9 
 
 
772 aa  130  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  37.55 
 
 
755 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.29 
 
 
576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  35.02 
 
 
572 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  29.45 
 
 
723 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  33.13 
 
 
618 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 
652 aa  127  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
730 aa  127  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  27.07 
 
 
585 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  35.91 
 
 
546 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
580 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.22 
 
 
585 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  34.63 
 
 
676 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.14 
 
 
618 aa  124  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  31.56 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.72 
 
 
702 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.48 
 
 
523 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.1 
 
 
847 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 
544 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.25 
 
 
450 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 
581 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.12 
 
 
1332 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
693 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 
930 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  40.64 
 
 
409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
956 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  33.67 
 
 
512 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1248 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>