39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3069 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  100 
 
 
484 aa  923    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  58.35 
 
 
440 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  56.19 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  54.15 
 
 
449 aa  382  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  53.78 
 
 
471 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  51.38 
 
 
441 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  43.35 
 
 
507 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  45.28 
 
 
518 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  45.39 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  45.13 
 
 
519 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  45.12 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  42.51 
 
 
517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  40.31 
 
 
470 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  39.14 
 
 
425 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  38.95 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  30.48 
 
 
168 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  35.04 
 
 
175 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  36.63 
 
 
168 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  27.18 
 
 
174 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  27.18 
 
 
174 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  32.35 
 
 
177 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  28.79 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  30.19 
 
 
170 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  33.02 
 
 
175 aa  47  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  33.66 
 
 
166 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  32.76 
 
 
179 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>