More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3068 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  69.03 
 
 		 574 aa  749    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  67.82 
 
 		 574 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 605 aa  1200    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  61.68 
 
 		 566 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.14 
 
 		 609 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  62.75 
 
 		 584 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  60.04 
 
 		 603 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  59.64 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  58.7 
 
 		 585 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.11 
 
 		 595 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  58.05 
 
 		 578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  58.09 
 
 		 607 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.53 
 
 		 584 aa  572  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  56.57 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.95 
 
 		 631 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  55.99 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  56.24 
 
 		 584 aa  555  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  57.58 
 
 		 590 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  53.4 
 
 		 578 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  54.11 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  55.13 
 
 		 613 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  54.82 
 
 		 616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.04 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  53.92 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  52.67 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  52.67 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  52.67 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  51.59 
 
 		 645 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.28 
 
 		 595 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  46.18 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.81 
 
 		 565 aa  237  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  41.96 
 
 		 560 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.71 
 
 		 475 aa  183  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.59 
 
 		 463 aa  160  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  36.5 
 
 		 1407 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  41.5 
 
 		 1397 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.02 
 
 		 453 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  38.92 
 
 		 1433 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  40.98 
 
 		 1449 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  40.98 
 
 		 1449 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  30.51 
 
 		 615 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  36.3 
 
 		 673 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.92 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.11 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  30.91 
 
 		 631 aa  143  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.45 
 
 		 1465 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  38.92 
 
 		 1442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 628 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.45 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.08 
 
 		 457 aa  141  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.61 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  30.2 
 
 		 616 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 		 649 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 619 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  41.15 
 
 		 1402 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 		 617 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 663 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  28.61 
 
 		 625 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 628 aa  137  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  28.74 
 
 		 641 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  34.34 
 
 		 1527 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  36.48 
 
 		 623 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  27.78 
 
 		 615 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  30.84 
 
 		 624 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  33.79 
 
 		 657 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 		 684 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 		 684 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 674 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 687 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.2 
 
 		 607 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  35.02 
 
 		 654 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  31.12 
 
 		 629 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  33.2 
 
 		 607 aa  134  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  30.38 
 
 		 628 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  34.24 
 
 		 753 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 681 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 681 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 682 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 613 aa  133  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36.65 
 
 		 1426 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 		 740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 		 747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  35.14 
 
 		 1390 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.93 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 		 749 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  34.01 
 
 		 747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  29.44 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.26 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  42.47 
 
 		 1440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.59 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 747 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  33.99 
 
 		 742 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.75 
 
 		 614 aa  132  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 747 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>