More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2912 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  100 
 
 
193 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  62.65 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  57.79 
 
 
243 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  59.62 
 
 
201 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  53.02 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  49.38 
 
 
198 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  52.33 
 
 
182 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  63.35 
 
 
165 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  44.21 
 
 
272 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 
212 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  54.86 
 
 
197 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  59.44 
 
 
238 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  55.97 
 
 
291 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
195 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  56.44 
 
 
232 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  45.16 
 
 
234 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  56.44 
 
 
220 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  55 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  51.45 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  51.48 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  47.93 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 
204 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 
230 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 
230 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  48.57 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 
207 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  48.41 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  47.3 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  45.24 
 
 
227 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 
149 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  37.71 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.58 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  38.35 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  34.16 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  36.3 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  36.81 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  51.92 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  30.13 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  39.1 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  36.42 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  32.67 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>