161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2851 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 371 aa  748    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000258612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  52.71 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  54.58 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  54.79 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  48.9 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  52.13 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  50.54 
 
 		 292 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.96 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  22.89 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  27.62 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  27.62 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  27.62 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  26.67 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  23.93 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.61 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0315  polysaccharide deacetylase-like protein  28.18 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0330  polysaccharide deacetylase-like protein  28.18 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0362  polysaccharide deacetylase-like protein  28.18 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  22.69 
 
 		 890 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0302  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.41 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 645 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  22.91 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.61 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  27.96 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  27.96 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  27.96 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 627 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  20.95 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  27.96 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  24.65 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 594 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 204 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.49 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  25.81 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 522 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  26.74 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  23.44 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 630 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  26.16 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  28.06 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 898 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  28.49 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 242 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  22.18 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 217 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  25.27 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 615 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 212 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 615 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 242 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>