More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2765 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  55.74 
 
 
310 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  52.04 
 
 
319 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
312 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
311 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  43.28 
 
 
313 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  42.95 
 
 
313 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
308 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  36.42 
 
 
315 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  34.86 
 
 
644 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
326 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.66 
 
 
637 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 
314 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.2 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 
298 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
299 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
312 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 
317 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
337 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 
318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
331 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 
333 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  31.42 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.25 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.93 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.07 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
318 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.81 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
342 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.9 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  29.23 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.92 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.03 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  24.91 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
294 aa  89  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.7 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  29.05 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.68 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
336 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.06 
 
 
335 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.06 
 
 
335 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 
319 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 
316 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 
319 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25.87 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.41 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  29.17 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.32 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.11 
 
 
438 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.17 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  29.73 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  25.4 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.03 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.1 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.17 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  29.39 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>