More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2709 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 531 aa  1069    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.92 
 
 		 503 aa  309  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 499 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 520 aa  299  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 		 516 aa  299  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 		 532 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  36.06 
 
 		 529 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  38.06 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 		 514 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  39.88 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 525 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 496 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 		 1043 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  33.54 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 515 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 662 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  36.05 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.41 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  37.52 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.47 
 
 		 579 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 		 517 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  38.29 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 523 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 560 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 528 aa  267  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 508 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 528 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.4 
 
 		 529 aa  266  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 518 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 		 570 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 539 aa  263  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 526 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 536 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 530 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 531 aa  260  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 518 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.16 
 
 		 550 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 		 556 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 		 556 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.84 
 
 		 527 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.77 
 
 		 481 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 519 aa  257  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.63 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 		 524 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 527 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 		 510 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>