150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2547 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 861 aa  1735    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  39.52 
 
 		 1048 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.2 
 
 		 710 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.03 
 
 		 672 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.31 
 
 		 659 aa  272  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.17 
 
 		 645 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  32.39 
 
 		 719 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  32.88 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.82 
 
 		 717 aa  238  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.07 
 
 		 727 aa  237  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  32.86 
 
 		 666 aa  237  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  34.26 
 
 		 679 aa  237  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.96 
 
 		 670 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.49 
 
 		 695 aa  228  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  34.02 
 
 		 684 aa  226  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  32.41 
 
 		 695 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.25 
 
 		 733 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  30.89 
 
 		 680 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.85 
 
 		 692 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  28.59 
 
 		 734 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.09 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  30.16 
 
 		 706 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  28.17 
 
 		 726 aa  184  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.89 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.84 
 
 		 732 aa  171  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  28.94 
 
 		 703 aa  169  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.89 
 
 		 693 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  25.93 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.71 
 
 		 767 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.71 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.49 
 
 		 691 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  28.19 
 
 		 761 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  27.62 
 
 		 724 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  27.62 
 
 		 724 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.62 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  27.34 
 
 		 724 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.53 
 
 		 732 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.49 
 
 		 715 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.25 
 
 		 764 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.23 
 
 		 689 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  23.72 
 
 		 689 aa  146  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  23.72 
 
 		 689 aa  146  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  23.65 
 
 		 689 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  23.8 
 
 		 689 aa  145  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  23.39 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  27.49 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  23.89 
 
 		 691 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.49 
 
 		 748 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  22.89 
 
 		 691 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  23.39 
 
 		 689 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  30.15 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.39 
 
 		 813 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.81 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.08 
 
 		 763 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.97 
 
 		 766 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  22.81 
 
 		 689 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  31.99 
 
 		 759 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  25 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  27.99 
 
 		 759 aa  125  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  28.3 
 
 		 735 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.33 
 
 		 832 aa  121  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.36 
 
 		 799 aa  121  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  29.75 
 
 		 829 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.81 
 
 		 702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  38.26 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.94 
 
 		 804 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  36.48 
 
 		 765 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  37.97 
 
 		 771 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  37.6 
 
 		 874 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.91 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.68 
 
 		 788 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  37.02 
 
 		 754 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.43 
 
 		 746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  34.5 
 
 		 902 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  32.4 
 
 		 742 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  37.33 
 
 		 776 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.1 
 
 		 758 aa  112  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  29.53 
 
 		 715 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.34 
 
 		 742 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.4 
 
 		 786 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  33.06 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.61 
 
 		 716 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  33.2 
 
 		 705 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.81 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  22.21 
 
 		 703 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  21.92 
 
 		 755 aa  105  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 750 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  26.74 
 
 		 710 aa  98.6  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.07 
 
 		 685 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  25.47 
 
 		 852 aa  94.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  21.04 
 
 		 706 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  30.61 
 
 		 717 aa  90.9  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  21.25 
 
 		 706 aa  90.1  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.22 
 
 		 703 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.37 
 
 		 706 aa  85.9  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.09 
 
 		 755 aa  84.7  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  26.96 
 
 		 748 aa  81.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  23.76 
 
 		 785 aa  79.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  28.85 
 
 		 760 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>