More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2407 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  64.87 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  57.34 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  56.93 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  53.65 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  47.22 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  44.75 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.69 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.21 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  38.03 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  38.01 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.68 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.91 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.3 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.29 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.5 
 
 		 249 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.67 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.84 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.39 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.31 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  37.08 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.22 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.02 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.22 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.07 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  41.28 
 
 		 275 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  37.96 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  33.33 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  32.26 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  35.93 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  35.78 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  32.27 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  37.32 
 
 		 665 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  31.1 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  32.57 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  33.93 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  34.58 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.6 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  30.52 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>