More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2301 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  74.58 
 
 
266 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  74.26 
 
 
455 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  77.19 
 
 
445 aa  363  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  72.47 
 
 
277 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  66.11 
 
 
253 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  71.98 
 
 
255 aa  341  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  68.94 
 
 
256 aa  339  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  70.69 
 
 
255 aa  338  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  69.66 
 
 
262 aa  337  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  69.23 
 
 
255 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.54 
 
 
253 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  67.36 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  64.71 
 
 
277 aa  322  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  65.55 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  66.08 
 
 
261 aa  319  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.14 
 
 
250 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.93 
 
 
291 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.14 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  67.48 
 
 
257 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.8 
 
 
258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  63.07 
 
 
258 aa  308  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  59.06 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.25 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
271 aa  301  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  60.32 
 
 
252 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.87 
 
 
247 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.44 
 
 
280 aa  299  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  66.25 
 
 
258 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.67 
 
 
274 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.04 
 
 
243 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  60.26 
 
 
258 aa  291  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.11 
 
 
264 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  58.19 
 
 
263 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  61.97 
 
 
255 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  64.02 
 
 
312 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  62.01 
 
 
252 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 
279 aa  286  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  62.4 
 
 
293 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  58.58 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.95 
 
 
244 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.78 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  63.76 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.71 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  60.08 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.47 
 
 
288 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.33 
 
 
256 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  54.33 
 
 
253 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.48 
 
 
243 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.59 
 
 
272 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.53 
 
 
245 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.27 
 
 
269 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.73 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.81 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
245 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.44 
 
 
277 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
241 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
247 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
255 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  52.84 
 
 
244 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
255 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
279 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.61 
 
 
224 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  58.26 
 
 
249 aa  234  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.61 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  51.48 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.84 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.91 
 
 
230 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 
240 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.61 
 
 
239 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.3 
 
 
225 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
227 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  50.95 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.73 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  40.39 
 
 
293 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.37 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
252 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  52.09 
 
 
228 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.51 
 
 
231 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  54.98 
 
 
249 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
231 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.75 
 
 
227 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
246 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.67 
 
 
240 aa  208  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.65 
 
 
227 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 
229 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  48.39 
 
 
229 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
224 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.33 
 
 
229 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 
231 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.95 
 
 
225 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.37 
 
 
251 aa  205  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
229 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.64 
 
 
268 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  46.61 
 
 
231 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.91 
 
 
235 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
246 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 
222 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>