More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2259 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  61.89 
 
 		 613 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  62.19 
 
 		 612 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 616 aa  1251    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  51.95 
 
 		 608 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  46.01 
 
 		 612 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  45.1 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  46.82 
 
 		 601 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  42.64 
 
 		 607 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.75 
 
 		 599 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 626 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 623 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  43.61 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 602 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 599 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 653 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 649 aa  349  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 606 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 606 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 600 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 599 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 606 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 616 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 607 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 622 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 595 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 591 aa  336  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 603 aa  336  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 		 597 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 602 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 612 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 604 aa  334  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 615 aa  334  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 604 aa  333  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 603 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 605 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 604 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 606 aa  323  7e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 612 aa  321  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 604 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 604 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 601 aa  320  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 633 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 593 aa  317  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 607 aa  316  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.32 
 
 		 599 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45510  long chain acyl-coa synthetase  33.72 
 
 		 663 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 603 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 607 aa  313  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 606 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 611 aa  312  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 651 aa  311  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  33.23 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 606 aa  310  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 615 aa  310  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40730  predicted protein  34.97 
 
 		 623 aa  310  6.999999999999999e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.47 
 
 		 606 aa  309  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  34.39 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 599 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  31.43 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0461  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 644 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  33.56 
 
 		 607 aa  303  5.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.81 
 
 		 610 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 602 aa  303  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.43 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0470  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 682 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.146944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 613 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 596 aa  300  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 602 aa  300  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 605 aa  299  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1159  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>