More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2257 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.27 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.19 
 
 
225 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  36.87 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
223 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.86 
 
 
240 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.25 
 
 
212 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  34.54 
 
 
258 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.02 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.79 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 
235 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
231 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  32.87 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.54 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.24 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.63 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.33 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.61 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.38 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  31.64 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.72 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.43 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.7 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  35.71 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  30.96 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.84 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.13 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.73 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.9 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.94 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.65 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  26.8 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.07 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  27.13 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.61 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.73 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.87 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  26.06 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  26.6 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  27.7 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.67 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>