More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2230 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
117 aa  233  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  4.79191e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  69.67 
 
 
122 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  68.6 
 
 
121 aa  162  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  78.79 
 
 
103 aa  158  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  69.57 
 
 
129 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  67.48 
 
 
123 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  72.9 
 
 
143 aa  156  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  80.81 
 
 
138 aa  156  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  72.22 
 
 
107 aa  155  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  70.09 
 
 
149 aa  155  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  78.43 
 
 
140 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  66.91 
 
 
134 aa  154  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  76.7 
 
 
129 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  66.94 
 
 
136 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  72.97 
 
 
115 aa  154  5e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44171e-09  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  66.95 
 
 
117 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  73.2 
 
 
120 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  76.6 
 
 
111 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  64.17 
 
 
134 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  62.96 
 
 
110 aa  151  3e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  69.81 
 
 
108 aa  151  3e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  64.66 
 
 
117 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  70.48 
 
 
122 aa  149  9e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  71.17 
 
 
112 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  71.17 
 
 
112 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  71.17 
 
 
112 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  68.7 
 
 
119 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  71.13 
 
 
109 aa  147  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  73.53 
 
 
115 aa  146  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  62.18 
 
 
121 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  68.87 
 
 
142 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.01574e-06  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  64.04 
 
 
135 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  64.65 
 
 
110 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  62.62 
 
 
108 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  60.61 
 
 
110 aa  135  3e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  66.99 
 
 
131 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  60.2 
 
 
157 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  59.18 
 
 
197 aa  118  2e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  48.76 
 
 
118 aa  114  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  48.54 
 
 
124 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  46.6 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  48 
 
 
142 aa  93.2  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  40.74 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  53.76 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.09 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
99 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  47.31 
 
 
238 aa  84  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 
100 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  45.16 
 
 
113 aa  83.2  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  44.94 
 
 
96 aa  82.8  1e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  82  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  4.88551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  43.43 
 
 
105 aa  80.9  5e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  40.68 
 
 
138 aa  79.7  1e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  79  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  40.91 
 
 
113 aa  79.3  2e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
109 aa  77.8  5e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  39.8 
 
 
160 aa  77.8  5e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  77.4  6e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  38.3 
 
 
123 aa  77  7e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  77  7e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  76.6  9e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  40.95 
 
 
109 aa  76.6  9e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  76.6  9e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 
100 aa  76.3  1e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  4.20765e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
108 aa  76.6  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  75.5  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  38.95 
 
 
200 aa  75.9  2e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  37.6 
 
 
144 aa  75.1  3e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 
133 aa  74.7  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  41.41 
 
 
102 aa  74.7  4e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  40.86 
 
 
104 aa  74.3  5e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  37.04 
 
 
120 aa  73.6  8e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  36.08 
 
 
156 aa  73.6  8e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  39 
 
 
98 aa  73.6  9e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  73.2  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  39 
 
 
185 aa  73.2  1e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  36.08 
 
 
212 aa  72.4  2e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
99 aa  72.8  2e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
105 aa  72  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  35.59 
 
 
121 aa  72.4  2e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.66 
 
 
106 aa  71.6  3e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  34.65 
 
 
131 aa  71.6  4e-12  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  41.41 
 
 
101 aa  71.2  4e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  40.18 
 
 
162 aa  70.9  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  71.2  5e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  42.39 
 
 
106 aa  71.2  5e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  39.05 
 
 
111 aa  70.9  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2106  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
134 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.070916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  37.96 
 
 
111 aa  70.9  6e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  39.39 
 
 
112 aa  70.5  7e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  34.65 
 
 
132 aa  70.1  9e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>