More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2220 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  100 
 
 
308 aa  598  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  79.67 
 
 
302 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  79.73 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  72.13 
 
 
309 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  70.97 
 
 
313 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  65.71 
 
 
312 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  69.49 
 
 
388 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  72.95 
 
 
374 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  65.15 
 
 
308 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.14 
 
 
308 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  61.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  60.86 
 
 
309 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  59.68 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  59.68 
 
 
310 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  59.68 
 
 
310 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  63.31 
 
 
338 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.67 
 
 
304 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  57.84 
 
 
314 aa  342  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  62.83 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
310 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  55.19 
 
 
315 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
299 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  56.33 
 
 
319 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  49.5 
 
 
311 aa  282  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  55.59 
 
 
329 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  48 
 
 
322 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  48.62 
 
 
322 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  46.91 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
300 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  47.68 
 
 
302 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
306 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
302 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
299 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
305 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  45.39 
 
 
330 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
305 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.33 
 
 
305 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.63 
 
 
322 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.62 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  44.11 
 
 
285 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.46 
 
 
308 aa  218  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.94 
 
 
304 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  44.77 
 
 
305 aa  215  8e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.26 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.93 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
297 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
301 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.03 
 
 
319 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
314 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.23 
 
 
284 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.58 
 
 
313 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  43.73 
 
 
301 aa  208  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
317 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.46 
 
 
310 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  46.42 
 
 
323 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  53.02 
 
 
237 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.51 
 
 
283 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.07 
 
 
254 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.47 
 
 
290 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.39 
 
 
322 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
280 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41 
 
 
282 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
308 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.79 
 
 
286 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
337 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.47 
 
 
321 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  42.9 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.67 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  39.03 
 
 
312 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
333 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43.05 
 
 
741 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.13 
 
 
326 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.81 
 
 
295 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 
308 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 
332 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
309 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
319 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.07 
 
 
310 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.49 
 
 
284 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  41.75 
 
 
303 aa  188  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40.47 
 
 
276 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 
324 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
321 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  39.14 
 
 
321 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.96 
 
 
339 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.04 
 
 
305 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.58 
 
 
299 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.34 
 
 
324 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.42 
 
 
306 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  43.81 
 
 
294 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.24 
 
 
312 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>