92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2217 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
351 aa  684  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  8.99528e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  55.38 
 
 
328 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  57.05 
 
 
329 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  56.37 
 
 
351 aa  289  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  52.96 
 
 
370 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  45.03 
 
 
386 aa  213  4e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  50.17 
 
 
325 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.56603e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  44.29 
 
 
325 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  46.71 
 
 
351 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.44 
 
 
323 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  45.28 
 
 
337 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  49.13 
 
 
326 aa  196  5e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  49.47 
 
 
309 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 
342 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 
321 aa  179  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  43.37 
 
 
337 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  44.41 
 
 
370 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  44.25 
 
 
322 aa  175  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  45.02 
 
 
305 aa  172  7e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  45.74 
 
 
313 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  42.11 
 
 
301 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  42.41 
 
 
328 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  40.71 
 
 
348 aa  165  1e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.84 
 
 
338 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.47 
 
 
307 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  43.2 
 
 
320 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  41.24 
 
 
318 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  39.69 
 
 
326 aa  154  3e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  42.36 
 
 
314 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55712e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.59 
 
 
287 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  40.51 
 
 
342 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  40.51 
 
 
342 aa  149  1e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  42.22 
 
 
304 aa  147  2e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  38.28 
 
 
318 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  39.93 
 
 
318 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  35.99 
 
 
331 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 
342 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  39.55 
 
 
310 aa  130  2e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  43.98 
 
 
298 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.05 
 
 
622 aa  63.5  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  30.32 
 
 
335 aa  57.8  2e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
311 aa  58.2  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  27.88 
 
 
326 aa  57.8  3e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  29.68 
 
 
335 aa  57.4  4e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  27.09 
 
 
326 aa  57  5e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  27.56 
 
 
318 aa  55.8  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.46 
 
 
337 aa  55.1  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  29 
 
 
373 aa  55.1  2e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.32 
 
 
308 aa  52.8  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  23.84 
 
 
339 aa  52.4  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
361 aa  51.6  2e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.76 
 
 
323 aa  51.6  2e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 
367 aa  51.2  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  23.89 
 
 
342 aa  50.1  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.08 
 
 
308 aa  50.1  6e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.33 
 
 
376 aa  49.7  8e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  27.82 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  33.81 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  31.33 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  31.33 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.71 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  30.67 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  24.93 
 
 
383 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  29.37 
 
 
353 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.14 
 
 
363 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.06 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.55 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  29.41 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.86 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  24.49 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  29.32 
 
 
327 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.37 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.49 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  29.8 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.49 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  28.12 
 
 
327 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  7.50752e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>