51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2209 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  100 
 
 
319 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  2.67002e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  59.28 
 
 
308 aa  332  7e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  61.36 
 
 
303 aa  326  4e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  60.41 
 
 
314 aa  322  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  57.38 
 
 
308 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  56.42 
 
 
302 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  51.59 
 
 
379 aa  283  2e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  53.58 
 
 
376 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24418e-05 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  53.9 
 
 
406 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  52.22 
 
 
303 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  48.56 
 
 
338 aa  262  7e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  48.47 
 
 
306 aa  251  8e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  47.64 
 
 
305 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  46.98 
 
 
313 aa  243  2e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  50.17 
 
 
430 aa  242  8e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  48.64 
 
 
337 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  47.12 
 
 
305 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  48.8 
 
 
340 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  45.45 
 
 
302 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  43.88 
 
 
310 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  47.12 
 
 
313 aa  222  5e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63102e-07 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  44.41 
 
 
313 aa  220  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  48.66 
 
 
370 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  41.84 
 
 
311 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  44.59 
 
 
304 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  44.44 
 
 
303 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  44.44 
 
 
303 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  44.44 
 
 
303 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  40 
 
 
341 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  44.56 
 
 
303 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  43.29 
 
 
318 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  45.85 
 
 
373 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  47.14 
 
 
303 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  42.41 
 
 
571 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  42.86 
 
 
338 aa  205  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  46.44 
 
 
313 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  44.37 
 
 
313 aa  195  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  31.31 
 
 
356 aa  73.2  5e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  29.65 
 
 
370 aa  59.3  7e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  36.76 
 
 
378 aa  54.3  3e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.08 
 
 
377 aa  52  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  26.96 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.57 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  25.59 
 
 
445 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.76 
 
 
435 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.72 
 
 
428 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  24.34 
 
 
445 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.94 
 
 
428 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  25.13 
 
 
456 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  25.13 
 
 
456 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>