More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2132 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 463 aa  912    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  74.5 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  73.94 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  72.83 
 
 		 456 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  75.41 
 
 		 441 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  68.37 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  65.79 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  61.06 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  64.43 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  66.36 
 
 		 500 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  64.94 
 
 		 456 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  61.42 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  64.84 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  65.35 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  61.15 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  66.13 
 
 		 465 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  63.39 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  63.78 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  61.44 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  63.3 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  64 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  60.53 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  60.53 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  60.53 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  63.39 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  63.7 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  60.88 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  61.56 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  63.22 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  60.6 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  60.09 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  64.8 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  60.67 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  62.36 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  52.57 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  57.8 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  55.2 
 
 		 462 aa  445  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  53.72 
 
 		 437 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  53.92 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  55.66 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  53.62 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.8 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.1 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  62.98 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.77 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  57 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  51.64 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  52.52 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  53.56 
 
 		 423 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  52.31 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  54.01 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  48.7 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.99 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.24 
 
 		 731 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  51.15 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.66 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.94 
 
 		 739 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  45.11 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.27 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  46 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  44.08 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.63 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.91 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.64 
 
 		 726 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  47.67 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.39 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  46.01 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.65 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  45.29 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>