More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2128 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  795    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 
596 aa  792    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  67.92 
 
 
592 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 
600 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  790    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  72.24 
 
 
584 aa  865    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  73.46 
 
 
579 aa  896    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 
598 aa  820    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 
1019 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 
599 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 
584 aa  971    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
601 aa  784    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
585 aa  1192    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  77.87 
 
 
578 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 
610 aa  829    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 
607 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  69.4 
 
 
590 aa  843    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  71.68 
 
 
586 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  57.53 
 
 
598 aa  714    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 
609 aa  789    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
590 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 
572 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
592 aa  796    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  65.21 
 
 
604 aa  792    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 
599 aa  818    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 
590 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 
599 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  65.36 
 
 
596 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 
604 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 
601 aa  799    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 
592 aa  841    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  64.52 
 
 
600 aa  788    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  69.68 
 
 
590 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
590 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 
601 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 
590 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
592 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
601 aa  589  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
590 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
618 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
586 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
600 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
598 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
585 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
614 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
592 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
627 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
602 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
599 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
594 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
597 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
594 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
588 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
594 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
599 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
606 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
599 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
613 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
594 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
592 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
593 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
597 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
610 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
597 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
590 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
588 aa  555  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
590 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
599 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
602 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
594 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
590 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
593 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
590 aa  558  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
595 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
588 aa  555  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
598 aa  558  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
594 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
590 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
590 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
601 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
591 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
614 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
590 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
592 aa  549  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
590 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
596 aa  549  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
599 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>