More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2099 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  64.35 
 
 
717 aa  899  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  71.83 
 
 
719 aa  1004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  56.96 
 
 
770 aa  780  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  62.41 
 
 
726 aa  835  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  100 
 
 
719 aa  1441  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  75.46 
 
 
708 aa  1092  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  62.09 
 
 
713 aa  852  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  60.17 
 
 
722 aa  800  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  62.09 
 
 
713 aa  852  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  74.86 
 
 
710 aa  1045  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  59.42 
 
 
696 aa  763  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  57.68 
 
 
722 aa  799  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  60.5 
 
 
701 aa  838  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  61.51 
 
 
718 aa  895  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  64.27 
 
 
717 aa  899  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  64.02 
 
 
714 aa  904  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  68.36 
 
 
729 aa  950  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  56.47 
 
 
729 aa  775  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  62.09 
 
 
713 aa  852  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  59.17 
 
 
674 aa  745  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  63.69 
 
 
741 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  40.75 
 
 
670 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  40.58 
 
 
673 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.14 
 
 
682 aa  515  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  39.51 
 
 
695 aa  515  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.43 
 
 
696 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.42 
 
 
694 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.06 
 
 
692 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.8 
 
 
679 aa  508  1e-142  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.93 
 
 
680 aa  507  1e-142  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  39.52 
 
 
697 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  37.72 
 
 
695 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  37.97 
 
 
696 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.11 
 
 
696 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  39.34 
 
 
691 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.65 
 
 
667 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.69 
 
 
673 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  39.71 
 
 
686 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  39.32 
 
 
683 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  40.49 
 
 
696 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.77 
 
 
690 aa  482  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  40.03 
 
 
686 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  37.64 
 
 
697 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39 
 
 
683 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  37.41 
 
 
694 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  37.64 
 
 
701 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.26 
 
 
692 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  37 
 
 
697 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.76 
 
 
682 aa  472  1e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  36.95 
 
 
697 aa  471  1e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  37.25 
 
 
690 aa  468  1e-130  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  38.15 
 
 
694 aa  467  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  40.66 
 
 
688 aa  466  1e-130  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  38.67 
 
 
693 aa  467  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  39.45 
 
 
685 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  39.43 
 
 
701 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  36.51 
 
 
701 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  38.83 
 
 
686 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  38.24 
 
 
694 aa  465  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  37.73 
 
 
685 aa  461  1e-128  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  36.08 
 
 
682 aa  461  1e-128  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  38.41 
 
 
707 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  3.13892e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.57 
 
 
701 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  35.56 
 
 
693 aa  454  1e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  40.17 
 
 
677 aa  453  1e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  36.26 
 
 
691 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  37.5 
 
 
685 aa  451  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  38.42 
 
 
681 aa  452  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  37.32 
 
 
689 aa  447  1e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  34.75 
 
 
691 aa  448  1e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  38.08 
 
 
687 aa  447  1e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  41.03 
 
 
687 aa  449  1e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  36.48 
 
 
692 aa  447  1e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  37.14 
 
 
691 aa  446  1e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  37.77 
 
 
692 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  34.97 
 
 
691 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  37.82 
 
 
692 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  35.21 
 
 
693 aa  439  1e-122  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  37.96 
 
 
701 aa  442  1e-122  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.17 
 
 
688 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  35.53 
 
 
693 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  5.9659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  35.87 
 
 
683 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  37.2 
 
 
689 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  35.87 
 
 
683 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  35.1 
 
 
697 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  34.47 
 
 
691 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  35.35 
 
 
698 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.31076e-27 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  35.42 
 
 
692 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  40.63 
 
 
683 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  36.95 
 
 
692 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  36.11 
 
 
696 aa  430  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.52 
 
 
692 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  35.92 
 
 
693 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  7.68044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  37.22 
 
 
701 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.11 
 
 
691 aa  429  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.86 
 
 
692 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  35.92 
 
 
693 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  34.9 
 
 
697 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  2.18328e-05  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  35.42 
 
 
691 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  36.71 
 
 
692 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>