More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2095 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 
695 aa  808  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15440  threonyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 
660 aa  763  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.374739  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
673 aa  822  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
656 aa  822  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 
699 aa  815  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  4.46012e-05  hitchhiker  7.44788e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  62.4 
 
 
691 aa  830  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
684 aa  1398  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 
701 aa  936  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  61.05 
 
 
676 aa  814  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  69.35 
 
 
658 aa  951  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
672 aa  745  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 
659 aa  968  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
671 aa  806  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  58.5 
 
 
676 aa  808  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
684 aa  802  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 
666 aa  833  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
669 aa  825  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.6336e-12 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  62.68 
 
 
671 aa  812  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 
671 aa  821  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  5.66637e-05 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
672 aa  801  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  3.27769e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
691 aa  806  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
682 aa  841  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
684 aa  802  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
668 aa  825  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 
685 aa  909  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
669 aa  812  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 
666 aa  929  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  8.34751e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
692 aa  813  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.67606e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 
692 aa  848  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  71.47 
 
 
659 aa  970  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 
677 aa  804  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 
677 aa  810  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  61.8 
 
 
668 aa  836  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 
670 aa  818  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  73.67 
 
 
657 aa  1023  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
684 aa  802  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 
690 aa  837  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  73.02 
 
 
657 aa  983  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
648 aa  628  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
645 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
636 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
646 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
636 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
645 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
636 aa  608  1e-172  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
636 aa  602  1e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
604 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
649 aa  595  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
644 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
643 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
644 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1229  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
623 aa  587  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
644 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
644 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
659 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
644 aa  584  1e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
614 aa  583  1e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
638 aa  584  1e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
643 aa  583  1e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
582 aa  584  1e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.23411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
638 aa  582  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
582 aa  581  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
581 aa  579  1e-164  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
583 aa  572  1e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
640 aa  572  1e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  49.66 
 
 
582 aa  574  1e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.28118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
644 aa  572  1e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
640 aa  570  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
639 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
638 aa  568  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
596 aa  564  1e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
644 aa  565  1e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
635 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
644 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
634 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
635 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
611 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
644 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
638 aa  548  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
637 aa  545  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
633 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
647 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
637 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
611 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
639 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
637 aa  541  1e-152  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
652 aa  541  1e-152  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
610 aa  538  1e-152  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
645 aa  541  1e-152  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
595 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
649 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
608 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
647 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
662 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
643 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
604 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  45.13 
 
 
684 aa  535  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
635 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
648 aa  535  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
634 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>