37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2072 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  100 
 
 
419 aa  803  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.07578e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  38.4 
 
 
432 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  38.56 
 
 
427 aa  179  6e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  44.28 
 
 
497 aa  128  2e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  25.91 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  28.54 
 
 
391 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
401 aa  82.8  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  26.51 
 
 
415 aa  81.6  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  29.17 
 
 
365 aa  74.7  3e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  30.16 
 
 
348 aa  73.9  5e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  28.78 
 
 
409 aa  73.2  7e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  31.36 
 
 
347 aa  58.5  2e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  31.36 
 
 
347 aa  58.5  2e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  28.44 
 
 
341 aa  55.5  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  28.41 
 
 
431 aa  54.7  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  27.81 
 
 
347 aa  52.4  1e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  26.32 
 
 
381 aa  51.6  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  4e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  4e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  4e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  4e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  26.32 
 
 
362 aa  51.2  4e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  26.32 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  24.17 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6475e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  29.37 
 
 
363 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  26.84 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  26.84 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  23.5 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  24.51 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  28.97 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  24.91 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  25.56 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  23.13 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  20.32 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  24 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  29.27 
 
 
388 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>