33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2028 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2028  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
152 aa  310  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2398  hypothetical protein  43.06 
 
 
177 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796069  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12649  hypothetical protein  42.75 
 
 
179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2547  hypothetical protein  44.93 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0775927  decreased coverage  0.00000269458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0834  hypothetical protein  42.67 
 
 
153 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0423  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  32.59 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  32.17 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  32.58 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  28.1 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  26.71 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  29.23 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  32.45 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  33.8 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  25.33 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  33.1 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  29.66 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  24.24 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  31.94 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  27.01 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  26.06 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  38.57 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  31.51 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  23.66 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  27.07 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  27.15 
 
 
150 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  29.85 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  22.79 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  25 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>