217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2027 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 475 aa  940    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  74 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  72.52 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  71.04 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  70.9 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  57.14 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.82 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  54.98 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  52.07 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  49.38 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  53.97 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  50.52 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  49.9 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  51.36 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  51.36 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  52.39 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  48.85 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  54.41 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  54.95 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  49.79 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  48.43 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  49.17 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  49.69 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  45.68 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  48.64 
 
 		 480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  47.61 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.38 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  50.83 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  51.72 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  52.22 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  50.21 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  48.21 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  53.47 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  54.58 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  52.4 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  53.26 
 
 		 476 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  54.53 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  49.13 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  47.83 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  49.46 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  52.95 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  46.07 
 
 		 482 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.6 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  52.12 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  46.54 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  48.86 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  53.81 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  53.18 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  53.39 
 
 		 488 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  47.52 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.78 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.61 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  46.49 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  53.88 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  47.31 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  49.01 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.3 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  48.75 
 
 		 514 aa  398  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  45.25 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  47.52 
 
 		 486 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  46.17 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  46.28 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  52.53 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  45.15 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  47.95 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  45.36 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  46.76 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  46.27 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  46.56 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  45.89 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  44.73 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  51.15 
 
 		 988 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  47.27 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  44.56 
 
 		 963 aa  348  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.96 
 
 		 462 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  41.88 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.87 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.55 
 
 		 514 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.04 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  31.33 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.32 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  33.18 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  30.85 
 
 		 466 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  34.25 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  33.99 
 
 		 511 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.58 
 
 		 384 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  30.75 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  32 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  34.38 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  34.12 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.82 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.89 
 
 		 402 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  32.84 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  32.25 
 
 		 395 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  32.82 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  30.32 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  33.1 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  32.3 
 
 		 411 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  32.08 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  31.56 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>