More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2010 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 521 aa  973    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  54.9 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  54.28 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  53.2 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  55.86 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  56.05 
 
 		 501 aa  442  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  50.3 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  58.16 
 
 		 481 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  54.93 
 
 		 513 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  55.71 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  56.42 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  50.81 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  54.16 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  50.58 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  50.81 
 
 		 540 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  48.99 
 
 		 508 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 509 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  45.51 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 477 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 		 516 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  48.33 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 555 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  53.69 
 
 		 563 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 525 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  47.58 
 
 		 525 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 525 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 519 aa  360  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.27 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 601 aa  356  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 		 513 aa  356  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  48.79 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 		 524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 533 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 508 aa  323  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.57 
 
 		 535 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 490 aa  312  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.03 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.8 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  42.8 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 520 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 		 515 aa  262  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.04 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 511 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.61 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 504 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.26 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 494 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.74 
 
 		 513 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.38 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.03 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.27 
 
 		 501 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  38.51 
 
 		 502 aa  220  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  36.89 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  36.89 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  36.89 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  36.81 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  36.89 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 		 626 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 594 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.52 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>