More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2005 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.53 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.56 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2450  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.25 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  26.32 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  26.32 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  26.32 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  24.26 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.78 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.78 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.78 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.78 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.11 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.78 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  26.72 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  27.53 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0464969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.85 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.6 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  31.8 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  31.8 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  31.8 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  30.28 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>