More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1977 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  72.8 
 
 
535 aa  799  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  68.22 
 
 
535 aa  734  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  68.91 
 
 
535 aa  758  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  68.48 
 
 
535 aa  728  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  67.79 
 
 
535 aa  727  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  81.24 
 
 
529 aa  860  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  69.53 
 
 
536 aa  776  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  71.54 
 
 
535 aa  746  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  68.42 
 
 
535 aa  742  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  72.47 
 
 
533 aa  770  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  69.72 
 
 
535 aa  746  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  68.72 
 
 
538 aa  752  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  71.29 
 
 
535 aa  761  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  70.84 
 
 
535 aa  776  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  68.54 
 
 
535 aa  756  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  69.66 
 
 
535 aa  748  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1300  propionyl-CoA carboxylase  67.21 
 
 
534 aa  676  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122048  normal  0.144625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  81.02 
 
 
553 aa  877  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  67.6 
 
 
553 aa  751  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  68.35 
 
 
535 aa  755  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05479  propionyl-CoA carboxylase subunit beta  58.35 
 
 
534 aa  649  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  70.97 
 
 
535 aa  738  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  66.79 
 
 
554 aa  764  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  70.28 
 
 
535 aa  778  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  70.79 
 
 
535 aa  769  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  71.43 
 
 
540 aa  761  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4244  propionyl-CoA carboxylase  69.72 
 
 
535 aa  759  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  72.8 
 
 
535 aa  790  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  70.97 
 
 
534 aa  773  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  70.97 
 
 
535 aa  768  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  74.16 
 
 
534 aa  802  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  66.85 
 
 
535 aa  749  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  80.15 
 
 
516 aa  847  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3704  propionyl-CoA carboxylase  79.65 
 
 
516 aa  835  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488669  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  68.54 
 
 
535 aa  748  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  72.8 
 
 
535 aa  790  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1170  propionyl-CoA carboxylase  66.35 
 
 
558 aa  682  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631698  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  67.17 
 
 
535 aa  738  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  68.91 
 
 
535 aa  756  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2011  propionyl-CoA carboxylase  67.35 
 
 
534 aa  690  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2552  propionyl-CoA carboxylase  80.16 
 
 
516 aa  834  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15771  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  67.23 
 
 
535 aa  742  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  72.8 
 
 
535 aa  790  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  72.8 
 
 
535 aa  786  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3636  propionyl-CoA carboxylase  79.45 
 
 
516 aa  835  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  72.98 
 
 
535 aa  789  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  68.16 
 
 
535 aa  752  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0147  propionyl-CoA carboxylase  78.32 
 
 
503 aa  806  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  80.41 
 
 
541 aa  874  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  85.02 
 
 
533 aa  931  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  72.98 
 
 
535 aa  798  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  69.59 
 
 
536 aa  754  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06850  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  70.96 
 
 
538 aa  741  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.85 
 
 
542 aa  778  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  72.04 
 
 
539 aa  769  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  66.04 
 
 
535 aa  706  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  71.16 
 
 
534 aa  773  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7689  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta subunit  72.3 
 
 
511 aa  754  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0290  carboxyl transferase  70.5 
 
 
535 aa  726  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  84.17 
 
 
537 aa  924  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1729  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  77.01 
 
 
529 aa  760  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231306  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  82.42 
 
 
529 aa  876  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3321  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  70.14 
 
 
510 aa  729  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  80.68 
 
 
533 aa  859  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0235  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  69.67 
 
 
507 aa  693  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318135  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6413  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  80.38 
 
 
522 aa  865  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0804402  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2100  Propionyl-CoA carboxylase  69.26 
 
 
541 aa  750  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.414224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  100 
 
 
534 aa  1086  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  6.65967e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001542  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  60.41 
 
 
534 aa  673  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  62.29 
 
 
535 aa  692  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  73.67 
 
 
526 aa  780  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.642597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  74.25 
 
 
535 aa  820  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.53852e-12 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  69.85 
 
 
535 aa  753  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  72.05 
 
 
535 aa  790  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  71.48 
 
 
535 aa  792  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  70.45 
 
 
540 aa  763  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  71.67 
 
 
535 aa  790  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2317  propionyl-CoA carboxylase  70.31 
 
 
535 aa  716  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.0246946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  67.42 
 
 
535 aa  744  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  68.42 
 
 
535 aa  739  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  71.99 
 
 
535 aa  785  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  68.52 
 
 
538 aa  749  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  68.61 
 
 
535 aa  744  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  7.13312e-10 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  71.48 
 
 
535 aa  790  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  72.8 
 
 
535 aa  796  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  70 
 
 
531 aa  729  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.123454  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19329  predicted protein  60.51 
 
 
597 aa  672  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3433  Propionyl-CoA carboxylase  69.23 
 
 
531 aa  738  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  68.54 
 
 
535 aa  756  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  71.91 
 
 
535 aa  800  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  69.59 
 
 
536 aa  751  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  67.92 
 
 
535 aa  763  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  73.46 
 
 
536 aa  800  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  71.62 
 
 
534 aa  769  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  73.46 
 
 
536 aa  797  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  66.42 
 
 
535 aa  758  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  71.86 
 
 
535 aa  788  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2508  methylcrotonyl-CoA carboxylase beta chain  66.17 
 
 
558 aa  680  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  72.05 
 
 
535 aa  793  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  67.48 
 
 
535 aa  770  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>