More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1898 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 268 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.52 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  39.05 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 342 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  28.9 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.15 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 330 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.77 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  28.37 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>