More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1884 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  100 
 
 
333 aa  680    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.4 
 
 
363 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  49.18 
 
 
322 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  47.26 
 
 
707 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.92 
 
 
685 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.36 
 
 
330 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44 
 
 
330 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  44.19 
 
 
340 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.54 
 
 
326 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.54 
 
 
326 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.61 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.74 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  41.38 
 
 
340 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  42.35 
 
 
338 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  39.26 
 
 
341 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  41.4 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  33.78 
 
 
325 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.13 
 
 
364 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.27 
 
 
352 aa  156  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.79 
 
 
393 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  33.33 
 
 
372 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.31 
 
 
368 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  32.19 
 
 
461 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  39.51 
 
 
465 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.98 
 
 
369 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.98 
 
 
369 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.98 
 
 
369 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  35.15 
 
 
351 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.92 
 
 
459 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  33.56 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  31.75 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  38.31 
 
 
456 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.25 
 
 
465 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  32.69 
 
 
454 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.99 
 
 
371 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.99 
 
 
371 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.49 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  37.67 
 
 
458 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.17 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  36.84 
 
 
315 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  35.76 
 
 
315 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  35.03 
 
 
455 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  35.69 
 
 
303 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  31.97 
 
 
459 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  37.59 
 
 
336 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  33 
 
 
458 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  35.12 
 
 
303 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.06 
 
 
459 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  35.12 
 
 
303 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  34.78 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.77 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  34.78 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  34.78 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  28.57 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  35.83 
 
 
315 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  34.31 
 
 
315 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  35.35 
 
 
303 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.43 
 
 
479 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  32.5 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  32.98 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  30.62 
 
 
457 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  32.32 
 
 
332 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  36.33 
 
 
469 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  35.05 
 
 
302 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.63 
 
 
459 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  35.97 
 
 
299 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  30.7 
 
 
479 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  34.77 
 
 
315 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  30.62 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  31.54 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  31.18 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  38.02 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  32.18 
 
 
336 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  36.15 
 
 
462 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  36.92 
 
 
354 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  33.77 
 
 
459 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.19 
 
 
453 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  35.07 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.71 
 
 
461 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  32.77 
 
 
773 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  38.31 
 
 
464 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  35.07 
 
 
456 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  34.15 
 
 
316 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  34.78 
 
 
295 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  34 
 
 
331 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  34.81 
 
 
463 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  33.33 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  36.3 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  33.57 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29 
 
 
346 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>