298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1851 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  100 
 
 
660 aa  1283  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  37.24 
 
 
309 aa  170  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  43.55 
 
 
326 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  47.09 
 
 
310 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  37.72 
 
 
310 aa  160  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  38.91 
 
 
316 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  42.31 
 
 
325 aa  155  3e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  34.39 
 
 
310 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  30.86 
 
 
323 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  32.28 
 
 
332 aa  147  7e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  36.14 
 
 
323 aa  144  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  35.6 
 
 
325 aa  142  2e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  142  2e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  34.7 
 
 
325 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  36.7 
 
 
321 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  38.46 
 
 
325 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  36.51 
 
 
316 aa  138  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  32.58 
 
 
327 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  36.46 
 
 
327 aa  137  6e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.54602e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  39.47 
 
 
316 aa  137  6e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  39.36 
 
 
279 aa  136  1e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  38.3 
 
 
320 aa  135  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.45 
 
 
332 aa  135  2e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  38.3 
 
 
320 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  35.18 
 
 
325 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  33.46 
 
 
330 aa  134  4e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  37.7 
 
 
325 aa  134  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  37.7 
 
 
325 aa  134  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  33.73 
 
 
336 aa  134  4e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  37.7 
 
 
325 aa  134  4e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  36.02 
 
 
323 aa  134  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  39.15 
 
 
329 aa  134  7e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  34.05 
 
 
321 aa  134  7e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.62 
 
 
325 aa  132  1e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.62 
 
 
325 aa  132  2e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  34.62 
 
 
325 aa  132  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  37.57 
 
 
322 aa  131  4e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  36.36 
 
 
322 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  35.96 
 
 
325 aa  130  7e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  39.01 
 
 
325 aa  129  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  36.17 
 
 
325 aa  130  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  38.46 
 
 
284 aa  130  1e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  36.28 
 
 
321 aa  129  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  35.96 
 
 
325 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  39.36 
 
 
326 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  34.14 
 
 
335 aa  127  4e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  35.45 
 
 
322 aa  127  8e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  34.02 
 
 
321 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  29.92 
 
 
282 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  34.33 
 
 
325 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  37.63 
 
 
325 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.05 
 
 
320 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  29.45 
 
 
322 aa  123  1e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  32.84 
 
 
321 aa  122  2e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  30.74 
 
 
282 aa  122  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  33.82 
 
 
325 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  34.65 
 
 
313 aa  120  8e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  34.62 
 
 
283 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  31.63 
 
 
275 aa  116  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  31.02 
 
 
535 aa  115  2e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  3.8758e-11 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  33.7 
 
 
323 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  28.46 
 
 
283 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.65 
 
 
322 aa  112  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  37.43 
 
 
321 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.6 
 
 
337 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.58 
 
 
337 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.8 
 
 
283 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  29.63 
 
 
322 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  29.63 
 
 
322 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.68 
 
 
314 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  35.16 
 
 
320 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.16 
 
 
320 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  32.98 
 
 
296 aa  107  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  31.67 
 
 
290 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  26.69 
 
 
325 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.73 
 
 
324 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.23 
 
 
324 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.48 
 
 
335 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.57 
 
 
323 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  28.57 
 
 
323 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.12 
 
 
335 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  28.26 
 
 
325 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  30.15 
 
 
322 aa  104  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  27.83 
 
 
325 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  33.5 
 
 
295 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.53 
 
 
310 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  30.88 
 
 
306 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.85 
 
 
323 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  28.57 
 
 
322 aa  101  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  23.99 
 
 
643 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.05 
 
 
317 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  29.69 
 
 
325 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  8.24726e-06  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  32.45 
 
 
328 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.56 
 
 
334 aa  99  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  27.27 
 
 
328 aa  97.8  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  34.04 
 
 
331 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  30.22 
 
 
306 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  34.04 
 
 
331 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  29.64 
 
 
318 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  34.04 
 
 
331 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>