More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1798 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  67.3 
 
 
532 aa  666  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  66.86 
 
 
521 aa  645  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 
528 aa  1039  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.86 
 
 
572 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  60.31 
 
 
540 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  58.17 
 
 
527 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  61.14 
 
 
545 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  55.39 
 
 
529 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.88 
 
 
518 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  59.42 
 
 
521 aa  538  1e-152  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  56.46 
 
 
527 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 
525 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 
525 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 
525 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  59.35 
 
 
520 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.83 
 
 
531 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 
524 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.63 
 
 
550 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.86 
 
 
534 aa  405  1e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  41.61 
 
 
556 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 
533 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  35.37 
 
 
563 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.23586e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 
531 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  38.36 
 
 
531 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  38.78 
 
 
531 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  37.34 
 
 
583 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  37.36 
 
 
552 aa  327  2e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.91 
 
 
584 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  35.27 
 
 
559 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.06 
 
 
534 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.35 
 
 
538 aa  306  5e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.06 
 
 
565 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.96 
 
 
557 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 
554 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.65 
 
 
568 aa  292  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.43 
 
 
586 aa  283  8e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 
546 aa  282  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 
579 aa  275  1e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 
536 aa  258  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 
564 aa  255  1e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.35 
 
 
535 aa  254  2e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  35.33 
 
 
531 aa  245  1e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  36.15 
 
 
527 aa  243  4e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  34.63 
 
 
532 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.35 
 
 
534 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  38.16 
 
 
470 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
534 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.14 
 
 
502 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.95 
 
 
467 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.69679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.4 
 
 
465 aa  233  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  34.09 
 
 
532 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 
572 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 
510 aa  220  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  32.48 
 
 
513 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 
520 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  30.18 
 
 
484 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  30.65 
 
 
484 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.66 
 
 
516 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  30.18 
 
 
484 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.18 
 
 
484 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
484 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.78 
 
 
520 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.18 
 
 
484 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.18 
 
 
484 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  30.18 
 
 
484 aa  191  3e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  30.3 
 
 
484 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.47 
 
 
523 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  32.62 
 
 
517 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.95 
 
 
516 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.03 
 
 
554 aa  183  5e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
451 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.05 
 
 
476 aa  163  8e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.27 
 
 
477 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.03 
 
 
482 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 
474 aa  160  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 
455 aa  157  5e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  30.77 
 
 
472 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
472 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.97 
 
 
462 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.83 
 
 
453 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 
474 aa  153  9e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.91 
 
 
495 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.82 
 
 
473 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 
457 aa  149  1e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  29.49 
 
 
472 aa  149  1e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 
457 aa  149  1e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 
457 aa  149  1e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 
461 aa  147  4e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  28.31 
 
 
460 aa  147  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.86 
 
 
484 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.32 
 
 
460 aa  147  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  29.32 
 
 
474 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.03 
 
 
459 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.8 
 
 
471 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.41 
 
 
457 aa  143  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 
473 aa  143  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.63 
 
 
457 aa  142  1e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.39 
 
 
471 aa  142  1e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
474 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.29 
 
 
488 aa  140  5e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>