More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1733 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  100 
 
 
482 aa  978  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  65.94 
 
 
476 aa  615  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  64.76 
 
 
474 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  59.83 
 
 
478 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  61.39 
 
 
484 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  58.91 
 
 
472 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  60.09 
 
 
463 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  61.14 
 
 
478 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  55.01 
 
 
472 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  57.33 
 
 
459 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  56.06 
 
 
470 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  55.19 
 
 
444 aa  478  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  53.93 
 
 
467 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  56.89 
 
 
488 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  51.63 
 
 
452 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  51.14 
 
 
487 aa  469  1e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  52.95 
 
 
458 aa  468  1e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  54.95 
 
 
494 aa  471  1e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  52.47 
 
 
485 aa  469  1e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  54.26 
 
 
467 aa  466  1e-130  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  53.16 
 
 
478 aa  466  1e-130  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  55.41 
 
 
466 aa  467  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  51.81 
 
 
500 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  51.58 
 
 
494 aa  459  1e-128  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  51.56 
 
 
463 aa  460  1e-128  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  55.7 
 
 
474 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  51.08 
 
 
462 aa  452  1e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  49.35 
 
 
451 aa  452  1e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  51.36 
 
 
491 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  52.68 
 
 
482 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  53.94 
 
 
466 aa  446  1e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  51.43 
 
 
467 aa  447  1e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  55.7 
 
 
457 aa  445  1e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  52.32 
 
 
479 aa  446  1e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  51.31 
 
 
439 aa  438  1e-122  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  48.36 
 
 
456 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  47.2 
 
 
446 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  55.73 
 
 
471 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  50.43 
 
 
489 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  54.82 
 
 
448 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  55.58 
 
 
453 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  53.71 
 
 
447 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  46.98 
 
 
446 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  47.64 
 
 
446 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  50.98 
 
 
453 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  56.02 
 
 
472 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  47.57 
 
 
488 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  49.69 
 
 
517 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  51.47 
 
 
458 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  50.77 
 
 
455 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  47.42 
 
 
474 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  47.48 
 
 
438 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  46.17 
 
 
471 aa  417  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  52.61 
 
 
443 aa  416  1e-115  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  45.92 
 
 
446 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  51.77 
 
 
453 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  51.88 
 
 
436 aa  406  1e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  51.33 
 
 
437 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  48.9 
 
 
465 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  49.79 
 
 
456 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  46.34 
 
 
439 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  48.89 
 
 
470 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  47.99 
 
 
448 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  49.78 
 
 
455 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  45.02 
 
 
470 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  47.83 
 
 
450 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  41.85 
 
 
452 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  48.46 
 
 
440 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  51.4 
 
 
463 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  45.73 
 
 
453 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  47.29 
 
 
445 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  44.35 
 
 
447 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  46.56 
 
 
463 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  49.89 
 
 
444 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  44.71 
 
 
457 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  45.8 
 
 
452 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  47.66 
 
 
468 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  47.03 
 
 
440 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  48.68 
 
 
460 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  46.74 
 
 
482 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  46.07 
 
 
440 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  42.54 
 
 
451 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  42.54 
 
 
451 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  43.22 
 
 
499 aa  362  7e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  43.38 
 
 
909 aa  361  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  43.23 
 
 
457 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  42.09 
 
 
451 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  44.62 
 
 
450 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  42.43 
 
 
443 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  40.31 
 
 
450 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  44.87 
 
 
458 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  41.98 
 
 
443 aa  358  1e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  45.72 
 
 
479 aa  358  1e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  42.6 
 
 
447 aa  357  2e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  42.54 
 
 
451 aa  358  2e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  44.23 
 
 
473 aa  356  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  43.43 
 
 
443 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  45.36 
 
 
448 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  46.74 
 
 
435 aa  353  3e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  44.37 
 
 
457 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>