More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1728 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
208 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  2.59292e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.5 
 
 
212 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  54.33 
 
 
210 aa  179  3e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  37.97 
 
 
215 aa  131  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  38.74 
 
 
207 aa  130  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  34.65 
 
 
208 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39469e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
209 aa  128  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  128  7e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 
211 aa  128  7e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  128  8e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  128  8e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
209 aa  127  9e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  127  9e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  127  9e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.98 
 
 
210 aa  127  9e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87844e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.51 
 
 
210 aa  127  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  34.38 
 
 
213 aa  126  2e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 
210 aa  126  2e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  39.71 
 
 
228 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  42.01 
 
 
221 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.46 
 
 
210 aa  124  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  34.16 
 
 
208 aa  124  8e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.26843e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  39.13 
 
 
211 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  34.47 
 
 
211 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
218 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
218 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  38.21 
 
 
211 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  38.65 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  34.16 
 
 
208 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 
234 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  34.16 
 
 
208 aa  120  1e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
208 aa  120  1e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
213 aa  119  4e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  34.04 
 
 
210 aa  119  4e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  36.08 
 
 
212 aa  119  4e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 
209 aa  117  1e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  32.08 
 
 
231 aa  117  1e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  40.1 
 
 
215 aa  116  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.49 
 
 
206 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
210 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
210 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
214 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
208 aa  114  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
212 aa  113  2e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  33.66 
 
 
208 aa  113  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  33.66 
 
 
208 aa  113  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
213 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.25036e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  38.65 
 
 
211 aa  112  4e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  41.9 
 
 
209 aa  111  7e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  35.22 
 
 
248 aa  110  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 
213 aa  110  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
211 aa  110  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
210 aa  109  2e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 
216 aa  110  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
209 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 
208 aa  108  4e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
206 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.91 
 
 
212 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 
207 aa  108  8e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.26 
 
 
208 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 
208 aa  108  8e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.26 
 
 
208 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.02 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 
211 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.31121e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.07 
 
 
210 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
213 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
209 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  39.69 
 
 
213 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 
213 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
214 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 
218 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.02 
 
 
207 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 
213 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
208 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
208 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  39.18 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.66 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 
212 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 
210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 
208 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 
210 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.98 
 
 
216 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
207 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 
215 aa  101  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>