More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1727 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1102    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 		 584 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.04 
 
 		 561 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.71 
 
 		 582 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.71 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.52 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.07 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.07 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.52 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.89 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.89 
 
 		 582 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.89 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.71 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.83 
 
 		 568 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 566 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.47 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.25 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.72 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 591 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 558 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  43.72 
 
 		 569 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 564 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  38.88 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.35 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  36.79 
 
 		 569 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  36.61 
 
 		 569 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.71 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 567 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.78 
 
 		 563 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 577 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.2 
 
 		 557 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 584 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 584 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 586 aa  359  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 584 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.83 
 
 		 557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 579 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.37 
 
 		 557 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 573 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 569 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 		 569 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 560 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 558 aa  353  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 560 aa  353  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 549 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.3 
 
 		 557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 599 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 557 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  38.66 
 
 		 565 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 540 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 563 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.8 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 562 aa  349  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 		 560 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 562 aa  349  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 577 aa  349  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 557 aa  349  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 584 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 		 557 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>