More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1620 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1620  ABC transporter related protein  100 
 
 
218 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
314 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  46.57 
 
 
276 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  46.7 
 
 
321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.38 
 
 
324 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  38.46 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.82 
 
 
331 aa  128  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43.63 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  43.63 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
300 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.07 
 
 
284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
285 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
301 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40.19 
 
 
314 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
300 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
300 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
300 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
302 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
300 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 
353 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
300 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
310 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.18 
 
 
347 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
302 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
300 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.66 
 
 
300 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  41.36 
 
 
374 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
300 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  42.03 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.79 
 
 
310 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.15 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  38.65 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  41.84 
 
 
294 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
319 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.36 
 
 
313 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42.03 
 
 
301 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  40.2 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.14 
 
 
317 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.24 
 
 
326 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.69 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.66 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  40.1 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.18 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  40.37 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
330 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.5 
 
 
304 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  41.67 
 
 
284 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  37.61 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.98 
 
 
310 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  38.76 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  39.73 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
308 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.34 
 
 
308 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 
304 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  37.21 
 
 
312 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
310 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
301 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.04 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  41.24 
 
 
334 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  39.41 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33.03 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
246 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  37.44 
 
 
388 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  29.36 
 
 
254 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.28 
 
 
309 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
305 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  37.5 
 
 
309 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  32.2 
 
 
305 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  37.32 
 
 
310 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  37.32 
 
 
310 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 
309 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
281 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  37.32 
 
 
310 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 
313 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30.52 
 
 
283 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
300 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
302 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
237 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  36.59 
 
 
329 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  36.36 
 
 
319 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.74 
 
 
286 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
303 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  31.71 
 
 
301 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  28.44 
 
 
290 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
249 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  37.84 
 
 
324 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 
355 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  36.32 
 
 
307 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3294  ABC transporter related  33.33 
 
 
500 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.702748  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
313 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
345 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  35.75 
 
 
302 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
312 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  32.98 
 
 
299 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>