172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1600 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  100 
 
 
1383 aa  2746    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  29.83 
 
 
1500 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  39.67 
 
 
845 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  37.56 
 
 
843 aa  492  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  36.94 
 
 
849 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  38.03 
 
 
1324 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.49 
 
 
1309 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  35.16 
 
 
838 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  30.37 
 
 
1509 aa  423  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.53 
 
 
1523 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  32.9 
 
 
1314 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  36.12 
 
 
992 aa  360  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 
1000 aa  347  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  34.93 
 
 
900 aa  341  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.99 
 
 
859 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  35.58 
 
 
897 aa  332  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.13 
 
 
1311 aa  284  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.08 
 
 
1261 aa  282  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  31.16 
 
 
862 aa  256  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.4 
 
 
1068 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  33.17 
 
 
675 aa  250  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  33.61 
 
 
829 aa  249  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.02 
 
 
963 aa  249  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  31.05 
 
 
934 aa  241  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3105  hypothetical protein  34.12 
 
 
745 aa  241  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.890364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  30.62 
 
 
899 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.43 
 
 
1196 aa  233  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  33.27 
 
 
877 aa  225  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  34.5 
 
 
1199 aa  221  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
911 aa  215  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.6 
 
 
1010 aa  215  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  31.09 
 
 
1326 aa  212  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
785 aa  210  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.35 
 
 
892 aa  204  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.67 
 
 
1911 aa  184  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 
1288 aa  178  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 
1056 aa  176  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.42 
 
 
1050 aa  172  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 
1185 aa  171  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.26 
 
 
1039 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
1262 aa  164  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 
1424 aa  154  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
1088 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
924 aa  152  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.59 
 
 
828 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 
686 aa  146  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.79 
 
 
1131 aa  144  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.47 
 
 
1128 aa  144  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  31.99 
 
 
822 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 
1125 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 
1146 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
837 aa  127  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 
1186 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.04 
 
 
801 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
857 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
966 aa  121  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
814 aa  119  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
1105 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  24.7 
 
 
713 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.1 
 
 
822 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
1283 aa  110  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
1215 aa  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  33.59 
 
 
373 aa  108  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.38 
 
 
1488 aa  107  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.35 
 
 
1404 aa  106  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  34.58 
 
 
385 aa  106  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
843 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.12 
 
 
1328 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 
577 aa  103  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 
568 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
568 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
953 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 
767 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.46 
 
 
841 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
454 aa  97.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.81 
 
 
2145 aa  98.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  23.57 
 
 
1468 aa  92.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.7 
 
 
1212 aa  92.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  27.58 
 
 
457 aa  92  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  23.53 
 
 
793 aa  91.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
949 aa  91.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.39 
 
 
958 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  22.63 
 
 
672 aa  89.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.61 
 
 
1228 aa  89.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
284 aa  89  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.81 
 
 
1136 aa  88.6  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  32.69 
 
 
702 aa  86.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.93 
 
 
1550 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
776 aa  83.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
751 aa  82.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.93 
 
 
1290 aa  82.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.38 
 
 
1475 aa  82  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
885 aa  82  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.92 
 
 
919 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  22.1 
 
 
680 aa  77  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
1028 aa  75.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.19 
 
 
825 aa  75.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25.07 
 
 
1106 aa  75.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>