More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1591 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  75.23 
 
 		 253 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  65.2 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  61.23 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  57.96 
 
 		 222 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  41.67 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  44.92 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 206 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  44.34 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  40.72 
 
 		 221 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  41.89 
 
 		 303 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  41.55 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  44.39 
 
 		 201 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  35.58 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  42.33 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  34.58 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  43.69 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  43.94 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  42.5 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  43.88 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  41.94 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0591  Ribonuclease H  50 
 
 		 200 aa  125  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  39.11 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  43.56 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40.61 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  40.93 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  38.83 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  42.13 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 198 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  39.7 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  40.84 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  37.44 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  43.15 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  40.39 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 196 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  40.1 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  43.43 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  36.45 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  36.51 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  37.07 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  41.48 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  37.69 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  34.09 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  38.19 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  37.88 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  42.93 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  32.98 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  36.16 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  40.64 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  38.71 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  41.84 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  32.49 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  32.98 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 213 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.82 
 
 		 201 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  39.15 
 
 		 202 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  39.57 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  39.9 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  40.4 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>