More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1549 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
463 aa  915  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  69.67 
 
 
450 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.38 
 
 
454 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.81 
 
 
505 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  71.27 
 
 
454 aa  582  1e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  64.95 
 
 
500 aa  576  1e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  66.16 
 
 
493 aa  573  1e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  68.83 
 
 
519 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  70.02 
 
 
450 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.85 
 
 
517 aa  562  1e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.4 
 
 
503 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  66.09 
 
 
513 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.59 
 
 
491 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  69.02 
 
 
541 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.99 
 
 
488 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  65.24 
 
 
529 aa  540  1e-152  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  65.02 
 
 
529 aa  539  1e-152  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  65.43 
 
 
488 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  65.79 
 
 
516 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  62.8 
 
 
509 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.65 
 
 
480 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  69.5 
 
 
529 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  65.64 
 
 
481 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  63.06 
 
 
515 aa  517  1e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.15 
 
 
486 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  66.23 
 
 
500 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  62.15 
 
 
509 aa  505  1e-142  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  62.85 
 
 
485 aa  504  1e-142  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  62.85 
 
 
485 aa  504  1e-142  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  62.85 
 
 
485 aa  504  1e-142  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  65.64 
 
 
476 aa  508  1e-142  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  63.74 
 
 
481 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  61.47 
 
 
479 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  64.71 
 
 
504 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  63.28 
 
 
480 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  62.63 
 
 
482 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  55.49 
 
 
563 aa  467  1e-130  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  55.76 
 
 
560 aa  439  1e-122  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.89684e-08 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.35 
 
 
426 aa  337  3e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 
464 aa  330  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.4 
 
 
432 aa  315  1e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.06 
 
 
425 aa  314  3e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.26 
 
 
428 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.75 
 
 
463 aa  310  3e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  43.26 
 
 
423 aa  308  2e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.06 
 
 
482 aa  305  9e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  43.49 
 
 
430 aa  303  4e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  43.49 
 
 
430 aa  303  4e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.57 
 
 
435 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.47 
 
 
422 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.53 
 
 
464 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.62 
 
 
338 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.24 
 
 
437 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.56 
 
 
428 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  44.03 
 
 
428 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.79 
 
 
428 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  44.03 
 
 
428 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  43.56 
 
 
428 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  43.56 
 
 
428 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  43.29 
 
 
428 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  43.33 
 
 
428 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  43.33 
 
 
428 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.6 
 
 
424 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  43.02 
 
 
430 aa  290  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.66 
 
 
417 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.16 
 
 
434 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.52 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.83 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.8 
 
 
353 aa  286  6e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  49.54 
 
 
338 aa  286  6e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.67 
 
 
452 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.73 
 
 
458 aa  285  9e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52 
 
 
338 aa  285  1e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  40.14 
 
 
427 aa  285  1e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.61 
 
 
346 aa  285  1e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.36 
 
 
428 aa  285  1e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  49.85 
 
 
338 aa  283  6e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  42.92 
 
 
435 aa  282  8e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.28 
 
 
434 aa  282  8e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.39 
 
 
427 aa  282  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.18 
 
 
425 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  44.76 
 
 
419 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45 
 
 
426 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.46 
 
 
435 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  48.5 
 
 
425 aa  276  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  47.1 
 
 
423 aa  276  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  41.1 
 
 
439 aa  275  1e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.41 
 
 
429 aa  275  1e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.06 
 
 
338 aa  275  1e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  42.53 
 
 
424 aa  275  1e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.84 
 
 
415 aa  272  8e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  9.3637e-06  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  42.07 
 
 
424 aa  272  9e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  41.61 
 
 
424 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.61 
 
 
354 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  39.82 
 
 
439 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.61 
 
 
354 aa  270  3e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.49 
 
 
438 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.61 
 
 
354 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.44 
 
 
427 aa  269  6e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  41.01 
 
 
428 aa  268  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>