192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1544 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  80.59 
 
 
644 aa  1092    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  78.28 
 
 
655 aa  1067    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  78.18 
 
 
661 aa  1043    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  76.56 
 
 
679 aa  1016    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  77.78 
 
 
653 aa  1059    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  78.71 
 
 
654 aa  1060    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  75.78 
 
 
642 aa  999    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  78.32 
 
 
663 aa  1044    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  100 
 
 
640 aa  1303    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  81.09 
 
 
645 aa  1080    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  79.07 
 
 
645 aa  1041    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  78.02 
 
 
663 aa  1041    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  85.29 
 
 
640 aa  1139    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  84.06 
 
 
636 aa  1130    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  76.83 
 
 
677 aa  998    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 
619 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  43.74 
 
 
624 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 
618 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 
626 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 
633 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  47.05 
 
 
619 aa  547  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  44.37 
 
 
626 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  45.79 
 
 
828 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  45.2 
 
 
638 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 
614 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  43.83 
 
 
617 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  46.35 
 
 
842 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 
842 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  42.67 
 
 
613 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  45.32 
 
 
836 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 
657 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 
828 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 
897 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 
826 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  44.06 
 
 
828 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
628 aa  512  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  44.64 
 
 
898 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  43.25 
 
 
599 aa  508  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 
617 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 
617 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 
599 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 
812 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  43.99 
 
 
898 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  44.16 
 
 
898 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 
613 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  43 
 
 
627 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 
611 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 
849 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 
610 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 
817 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  41.9 
 
 
860 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
856 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  40.94 
 
 
852 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
857 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  40.91 
 
 
626 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  39.93 
 
 
597 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 
621 aa  457  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  40.51 
 
 
971 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  40.37 
 
 
879 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  41.1 
 
 
910 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  40.06 
 
 
626 aa  449  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 
874 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.07 
 
 
894 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  41.24 
 
 
897 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 
600 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.45 
 
 
872 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  39.56 
 
 
681 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  41.4 
 
 
864 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  39.28 
 
 
898 aa  435  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.72 
 
 
887 aa  435  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 
591 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.46 
 
 
860 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  39.21 
 
 
882 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  40.03 
 
 
922 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  40.62 
 
 
842 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 
600 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 
803 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  36.07 
 
 
573 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 
613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  35.49 
 
 
589 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 
593 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  34.7 
 
 
589 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 
589 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 
566 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  33.57 
 
 
557 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 
563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 
563 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  30.36 
 
 
559 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
544 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 
557 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
557 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
544 aa  243  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
551 aa  239  8e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  30.7 
 
 
544 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.05 
 
 
546 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  29.71 
 
 
540 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
543 aa  230  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 
528 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 
538 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
537 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>