More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1533 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  100 
 
 
451 aa  849    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  50.97 
 
 
664 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  51.53 
 
 
687 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.29 
 
 
461 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  49.86 
 
 
689 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  48.83 
 
 
720 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  48.31 
 
 
650 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  41.94 
 
 
691 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  43.63 
 
 
653 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
731 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  41.28 
 
 
686 aa  173  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
709 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.76 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.88 
 
 
391 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  42.37 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
624 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.6 
 
 
405 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
395 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  41.94 
 
 
429 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  39.63 
 
 
501 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  40.64 
 
 
463 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  36.71 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
463 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
725 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
417 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  44.59 
 
 
663 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.75 
 
 
585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  38.79 
 
 
481 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  41.07 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
370 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  30.32 
 
 
391 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  42.44 
 
 
485 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.55 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  30.4 
 
 
357 aa  117  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  45.63 
 
 
218 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  37.5 
 
 
696 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
401 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  34.39 
 
 
456 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  35.29 
 
 
467 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.84 
 
 
466 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
658 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
405 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
471 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  40.67 
 
 
442 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  37.21 
 
 
337 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
469 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
688 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  38.74 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
475 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
421 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  35.27 
 
 
383 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
564 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
339 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  34.77 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  36.97 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  34.3 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  36.14 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.62 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
665 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  37.86 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  35.21 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
462 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  33.05 
 
 
387 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  39.02 
 
 
458 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
462 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.85 
 
 
489 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  37.39 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
599 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  36.84 
 
 
461 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.39 
 
 
388 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
461 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.71 
 
 
386 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>