38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1505 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  47.22 
 
 
190 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  47.78 
 
 
190 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  47.22 
 
 
190 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  47.59 
 
 
171 aa  160  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  46.41 
 
 
191 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  46.41 
 
 
191 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  45.81 
 
 
189 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  46.37 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  42.54 
 
 
189 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  45.3 
 
 
191 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  46.67 
 
 
188 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  43.33 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  41.11 
 
 
192 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  38.33 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  37.78 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  42.34 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  35.68 
 
 
196 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  37.97 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  41.28 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  39.51 
 
 
181 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  34.78 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  32.04 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  34.36 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  39.69 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  29.51 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  45.92 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  34.78 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  34.07 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  33.59 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  34.46 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  26.47 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  27.43 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  25.67 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  28.32 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>