77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1448 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
164 aa  325  2e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  80 
 
 
151 aa  226  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  76.55 
 
 
151 aa  212  2e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.64 
 
 
142 aa  130  1e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  56 
 
 
196 aa  123  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  43.28 
 
 
200 aa  89  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
255 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 
288 aa  80.9  8e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  2.79842e-09 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
134 aa  77  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
160 aa  75.5  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.95 
 
 
130 aa  74.3  6e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 
171 aa  71.2  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
158 aa  68.2  5e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
187 aa  67  1e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
207 aa  66.2  2e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  38.02 
 
 
137 aa  66.2  2e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
155 aa  64.7  6e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
184 aa  64.3  8e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  38.98 
 
 
161 aa  63.9  8e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  37.31 
 
 
166 aa  63.5  1e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  36.51 
 
 
134 aa  60.5  9e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  5.40346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
150 aa  60.1  1e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
150 aa  59.7  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
137 aa  59.7  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  38.14 
 
 
148 aa  58.9  3e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 
151 aa  57  1e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
164 aa  55.8  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  34.07 
 
 
162 aa  55.5  3e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
150 aa  55.5  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0265  hypothetical protein  36.61 
 
 
163 aa  55.5  3e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.68 
 
 
151 aa  54.7  6e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 
149 aa  54.3  7e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  40.28 
 
 
158 aa  54.3  8e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
180 aa  53.5  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  35.66 
 
 
187 aa  52.4  3e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
174 aa  52  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.71 
 
 
164 aa  52  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
203 aa  51.6  5e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5442  putative signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
167 aa  51.2  6e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
166 aa  51.2  7e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  34.17 
 
 
164 aa  50.8  8e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1352  hypothetical protein  37.01 
 
 
145 aa  50.8  9e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  35.54 
 
 
145 aa  50.1  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.85 
 
 
616 aa  50.4  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  43.96 
 
 
136 aa  50.4  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.16 
 
 
694 aa  49.3  2e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
134 aa  49.7  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.28 
 
 
693 aa  49.7  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0857  hypothetical protein  31.93 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.079747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
122 aa  48.5  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
146 aa  48.5  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 
1225 aa  48.1  5e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
178 aa  47.8  7e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
216 aa  47.4  8e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
159 aa  47.4  8e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
185 aa  47.4  9e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.61 
 
 
282 aa  47.4  9e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
183 aa  47.4  9e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
192 aa  47.4  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  35.1 
 
 
176 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.36 
 
 
655 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0704  hypothetical protein  40.44 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
750 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
226 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2541  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.65 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.7405  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  23.47 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  34.31 
 
 
132 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5037  putative signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.476889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
389 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
389 aa  40.8  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>