33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1391 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  40.06 
 
 
353 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  39.58 
 
 
368 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.65 
 
 
348 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.65 
 
 
348 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.34 
 
 
348 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.02 
 
 
344 aa  184  2e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  36.05 
 
 
352 aa  182  5e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  36.64 
 
 
344 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.31 
 
 
358 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  34.97 
 
 
347 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.36 
 
 
354 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.07 
 
 
354 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  33.92 
 
 
360 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  34.55 
 
 
346 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  34.04 
 
 
355 aa  164  2e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.73 
 
 
358 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.03 
 
 
358 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.03 
 
 
358 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  33.13 
 
 
344 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  30.86 
 
 
354 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  33.72 
 
 
354 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  28.61 
 
 
352 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  42.38 
 
 
302 aa  132  8e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  27.42 
 
 
322 aa  50.4  4e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.25 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3007  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.05 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7861  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  30.11 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.2 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0425  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  31.67 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.313806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.65 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  32.48 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>