More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1370 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
413 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  55.14 
 
 
433 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.79 
 
 
399 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.37 
 
 
407 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
412 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
412 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
451 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
412 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
412 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.76 
 
 
412 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.87 
 
 
412 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  51.91 
 
 
405 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.64 
 
 
413 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  52.16 
 
 
414 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.11 
 
 
412 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.86 
 
 
413 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  49.11 
 
 
412 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.11 
 
 
412 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.89 
 
 
416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.59 
 
 
415 aa  362  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.05 
 
 
404 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.5 
 
 
425 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.67 
 
 
405 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
404 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
400 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
404 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
404 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 
400 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  50.39 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  51.58 
 
 
411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.02 
 
 
402 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  51.58 
 
 
411 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  54.39 
 
 
398 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.62 
 
 
417 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.39 
 
 
398 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  46.31 
 
 
422 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.49 
 
 
401 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.13 
 
 
403 aa  348  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.14 
 
 
398 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 
420 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.51 
 
 
395 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  52.27 
 
 
405 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.84 
 
 
426 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  51.77 
 
 
405 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.77 
 
 
415 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.37 
 
 
393 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.13 
 
 
425 aa  345  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.62 
 
 
434 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
412 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  48.86 
 
 
406 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.98 
 
 
393 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.98 
 
 
397 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.6 
 
 
413 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  48.99 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.73 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.33 
 
 
410 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.36 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.38 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.09 
 
 
429 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  49.38 
 
 
419 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.85 
 
 
424 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  48.89 
 
 
419 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  46.82 
 
 
414 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.6 
 
 
393 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.89 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  46.23 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.3 
 
 
392 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  51.13 
 
 
403 aa  316  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  45.59 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.84 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.08 
 
 
413 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.25 
 
 
418 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.58 
 
 
413 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  46.6 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.48 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  46.1 
 
 
411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  48.75 
 
 
416 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.11 
 
 
425 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.85 
 
 
411 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.51 
 
 
412 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.75 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
403 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  44.21 
 
 
326 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.82 
 
 
412 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.14 
 
 
410 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.11 
 
 
411 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.69 
 
 
395 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  42.11 
 
 
411 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.11 
 
 
411 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.72 
 
 
420 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.78 
 
 
415 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.55 
 
 
418 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3455  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.89 
 
 
225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.2 
 
 
395 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.35 
 
 
409 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.35 
 
 
401 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 
395 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  34.23 
 
 
400 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.57 
 
 
436 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.9 
 
 
395 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>