28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1363 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  335  1e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  49.69 
 
 
166 aa  163  1e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  56.13 
 
 
170 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  51.01 
 
 
154 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  47.77 
 
 
158 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  45.71 
 
 
184 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  45.39 
 
 
186 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  41.61 
 
 
157 aa  94.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  33.12 
 
 
284 aa  79.3  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  35.54 
 
 
164 aa  77  1e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  35.37 
 
 
159 aa  68.9  4e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  63.2  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  29.01 
 
 
171 aa  63.2  2e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.88 
 
 
160 aa  61.2  6e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.37 
 
 
160 aa  60.5  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  37.74 
 
 
158 aa  57.8  8e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  31.97 
 
 
162 aa  56.6  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  34.69 
 
 
162 aa  53.1  2e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  34.88 
 
 
156 aa  50.8  9e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  36.43 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  37.59 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  34.92 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  34.62 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  34.62 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  34.62 
 
 
161 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>