41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1336 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1119    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  55.49 
 
 		 518 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  53.62 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  31.52 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  32.02 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  32.33 
 
 		 339 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  27.19 
 
 		 565 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.66 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  26.38 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  28.79 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  30.18 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  29.35 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  26.79 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  29.26 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  24.4 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  29.53 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  28.46 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  29.93 
 
 		 320 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.07 
 
 		 487 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  29.05 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  24.39 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  35.29 
 
 		 475 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3308  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 500 aa  47  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.032044  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  32.43 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6759  putative HTH-type transcriptional regulator  26.49 
 
 		 427 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  24.68 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  24.5 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  32.74 
 
 		 431 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  30.6 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1015  putative DNA-binding protein  27.78 
 
 		 351 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  34.71 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>