22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1293 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  51.85 
 
 
219 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0048  hypothetical protein  51.35 
 
 
111 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  35.08 
 
 
214 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  36.73 
 
 
223 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  32.54 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  29.95 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  31.25 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  29.17 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  28.65 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  28.28 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  33.07 
 
 
257 aa  58.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  30.43 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  30.2 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  26.24 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4360  hypothetical protein  31.91 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0049  hypothetical protein  46.38 
 
 
66 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1919  abortive phage resistance protein-like  29.1 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000352931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3792  abortive phage resistance protein-like  29.1 
 
 
198 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1783  hypothetical protein  32.26 
 
 
236 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101547  normal  0.44958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1073  abortive phage resistance protein-like protein  27.69 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>